Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn3aA2ASI5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms