Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Patl2A2ARM1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms