Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rtf1A2AQ19 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Rtf1A2AQ19 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Rtf1A2AQ19 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Rtf1A2AQ19 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtf1A2AQ19 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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