Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd7A2AJK6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd7A2AJK6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chd7A2AJK6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chd7A2AJK6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chd7A2AJK6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chd7A2AJK6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Chd7A2AJK6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms