Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn6A2AJB9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Lcn6A2AJB9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms