Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc163A2AGD7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc163A2AGD7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms