Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms