Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col9a3A2ACT7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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Col9a3A2ACT7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Col9a3A2ACT7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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Col9a3A2ACT7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Col9a3A2ACT7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Col9a3A2ACT7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Col9a3A2ACT7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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Col9a3A2ACT7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col9a3A2ACT7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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