Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprfA2A8L5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprfA2A8L5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms