Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cul4bA2A432 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul4bA2A432 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms