Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1bA1Z198 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms