Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms