Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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