Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms