Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NgfrQ9Z0W1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NgfrQ9Z0W1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NgfrQ9Z0W1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms