Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp2Q9Z0E6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp2Q9Z0E6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp2Q9Z0E6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp2Q9Z0E6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp2Q9Z0E6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp2Q9Z0E6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp2Q9Z0E6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp2Q9Z0E6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp2Q9Z0E6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp2Q9Z0E6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp2Q9Z0E6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp2Q9Z0E6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp2Q9Z0E6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp2Q9Z0E6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp2Q9Z0E6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms