Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp18Q9WTV6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp18Q9WTV6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp18Q9WTV6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp18Q9WTV6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms