Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Plod1Q9R0E2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plod1Q9R0E2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod1Q9R0E2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.4 ms