Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK3

Cabp5, Calcium-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp5Q9JLK3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp5Q9JLK3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp5Q9JLK3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp5Q9JLK3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp5Q9JLK3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp5Q9JLK3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp5Q9JLK3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp5Q9JLK3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp5Q9JLK3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp5Q9JLK3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp5Q9JLK3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp5Q9JLK3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp5Q9JLK3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp5Q9JLK3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cabp5Q9JLK3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cabp5Q9JLK3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp5Q9JLK3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp5Q9JLK3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp5Q9JLK3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp5Q9JLK3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp5Q9JLK3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp5Q9JLK3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms