Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cyp3a44Q9EQW4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp3a44Q9EQW4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp3a44Q9EQW4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp3a44Q9EQW4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.8 ms