Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp2aQ9DB34 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chmp2aQ9DB34 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms