Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc52a3Q9D6X5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a3Q9D6X5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc52a3Q9D6X5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms