Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrameQ9D4Z5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrameQ9D4Z5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrameQ9D4Z5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrameQ9D4Z5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrameQ9D4Z5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrameQ9D4Z5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PrameQ9D4Z5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrameQ9D4Z5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrameQ9D4Z5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrameQ9D4Z5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrameQ9D4Z5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrameQ9D4Z5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.6 ms