Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms