Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud1Q9CUB6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud1Q9CUB6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud1Q9CUB6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.8 ms