Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ykt6Q9CQW1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ykt6Q9CQW1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ykt6Q9CQW1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms