Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asf1aQ9CQE6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asf1aQ9CQE6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asf1aQ9CQE6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Asf1aQ9CQE6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asf1aQ9CQE6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asf1aQ9CQE6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Asf1aQ9CQE6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asf1aQ9CQE6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asf1aQ9CQE6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asf1aQ9CQE6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Asf1aQ9CQE6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Asf1aQ9CQE6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Asf1aQ9CQE6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Asf1aQ9CQE6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Asf1aQ9CQE6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Asf1aQ9CQE6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Asf1aQ9CQE6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms