Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q99KU6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q99KU6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q99KU6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q99KU6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q99KU6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q99KU6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q99KU6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q99KU6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q99KU6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q99KU6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q99KU6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q99KU6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q99KU6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q99KU6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q99KU6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q99KU6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q99KU6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q99KU6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q99KU6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q99KU6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q99KU6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q99KU6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q99KU6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q99KU6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q99KU6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q99KU6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q99KU6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q99KU6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q99KU6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Q99KU6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q99KU6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q99KU6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q99KU6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q99KU6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q99KU6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q99KU6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Q99KU6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q99KU6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q99KU6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q99KU6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q99KU6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q99KU6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q99KU6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q99KU6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q99KU6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q99KU6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q99KU6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q99KU6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q99KU6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q99KU6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q99KU6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q99KU6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q99KU6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q99KU6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q99KU6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q99KU6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q99KU6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q99KU6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q99KU6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q99KU6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q99KU6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q99KU6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q99KU6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q99KU6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q99KU6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q99KU6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q99KU6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q99KU6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q99KU6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q99KU6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q99KU6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q99KU6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q99KU6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q99KU6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q99KU6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q99KU6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q99KU6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q99KU6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q99KU6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q99KU6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q99KU6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q99KU6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q99KU6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q99KU6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q99KU6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q99KU6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q99KU6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q99KU6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q99KU6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q99KU6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q99KU6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q99KU6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q99KU6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q99KU6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q99KU6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q99KU6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q99KU6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q99KU6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q99KU6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.5 ms