Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b5Q923D4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b5Q923D4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b5Q923D4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b5Q923D4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b5Q923D4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b5Q923D4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b5Q923D4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b5Q923D4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b5Q923D4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b5Q923D4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms