Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med28Q920D3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Med28Q920D3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med28Q920D3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms