Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PolbQ8K409 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PolbQ8K409 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PolbQ8K409 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PolbQ8K409 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PolbQ8K409 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PolbQ8K409 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PolbQ8K409 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolbQ8K409 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolbQ8K409 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms