Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efemp1Q8BPB5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efemp1Q8BPB5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Efemp1Q8BPB5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efemp1Q8BPB5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efemp1Q8BPB5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efemp1Q8BPB5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efemp1Q8BPB5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efemp1Q8BPB5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efemp1Q8BPB5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efemp1Q8BPB5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efemp1Q8BPB5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efemp1Q8BPB5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efemp1Q8BPB5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efemp1Q8BPB5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efemp1Q8BPB5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efemp1Q8BPB5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efemp1Q8BPB5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms