Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc172Q810N9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc172Q810N9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc172Q810N9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc172Q810N9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc172Q810N9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc172Q810N9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc172Q810N9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc172Q810N9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc172Q810N9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc172Q810N9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc172Q810N9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms