Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcg2Q7TMS5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcg2Q7TMS5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcg2Q7TMS5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcg2Q7TMS5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms