Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SyncripQ7TMK9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SyncripQ7TMK9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SyncripQ7TMK9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SyncripQ7TMK9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms