Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Syne2Q6ZWQ0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Syne2Q6ZWQ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms