Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH0

Tvp23a, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23aQ6NVH0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tvp23aQ6NVH0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tvp23aQ6NVH0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tvp23aQ6NVH0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms