Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rapgefl1Q68EF8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgefl1Q68EF8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgefl1Q68EF8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgefl1Q68EF8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgefl1Q68EF8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgefl1Q68EF8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgefl1Q68EF8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgefl1Q68EF8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgefl1Q68EF8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgefl1Q68EF8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgefl1Q68EF8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgefl1Q68EF8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgefl1Q68EF8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgefl1Q68EF8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgefl1Q68EF8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rapgefl1Q68EF8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgefl1Q68EF8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgefl1Q68EF8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgefl1Q68EF8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgefl1Q68EF8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgefl1Q68EF8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgefl1Q68EF8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgefl1Q68EF8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgefl1Q68EF8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgefl1Q68EF8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgefl1Q68EF8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgefl1Q68EF8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgefl1Q68EF8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgefl1Q68EF8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rapgefl1Q68EF8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rapgefl1Q68EF8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgefl1Q68EF8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgefl1Q68EF8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgefl1Q68EF8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgefl1Q68EF8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rapgefl1Q68EF8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rapgefl1Q68EF8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rapgefl1Q68EF8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms