Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phox2aQ62066 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phox2aQ62066 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phox2aQ62066 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms