Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msi1Q61474 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Msi1Q61474 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Msi1Q61474 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms