Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P4ha1Q60715 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
P4ha1Q60715 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
P4ha1Q60715 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
P4ha1Q60715 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P4ha1Q60715 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P4ha1Q60715 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
P4ha1Q60715 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
P4ha1Q60715 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P4ha1Q60715 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P4ha1Q60715 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
P4ha1Q60715 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P4ha1Q60715 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
P4ha1Q60715 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms