Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CttnQ60598 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CttnQ60598 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CttnQ60598 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CttnQ60598 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CttnQ60598 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CttnQ60598 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CttnQ60598 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CttnQ60598 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CttnQ60598 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CttnQ60598 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CttnQ60598 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CttnQ60598 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CttnQ60598 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CttnQ60598 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CttnQ60598 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CttnQ60598 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CttnQ60598 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CttnQ60598 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CttnQ60598 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CttnQ60598 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CttnQ60598 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CttnQ60598 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CttnQ60598 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CttnQ60598 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CttnQ60598 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CttnQ60598 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CttnQ60598 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CttnQ60598 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CttnQ60598 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CttnQ60598 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CttnQ60598 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CttnQ60598 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms