Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Usp48Q3V0C5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp48Q3V0C5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp48Q3V0C5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp48Q3V0C5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp48Q3V0C5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp48Q3V0C5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp48Q3V0C5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp48Q3V0C5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp48Q3V0C5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp48Q3V0C5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp48Q3V0C5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp48Q3V0C5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp48Q3V0C5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp48Q3V0C5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms