Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Skap2Q3UND0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skap2Q3UND0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skap2Q3UND0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skap2Q3UND0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms