Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Usp19Q3UJD6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Usp19Q3UJD6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Usp19Q3UJD6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Usp19Q3UJD6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Usp19Q3UJD6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp19Q3UJD6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp19Q3UJD6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp19Q3UJD6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp19Q3UJD6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp19Q3UJD6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Usp19Q3UJD6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Usp19Q3UJD6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp19Q3UJD6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Usp19Q3UJD6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Usp19Q3UJD6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Usp19Q3UJD6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Usp19Q3UJD6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Usp19Q3UJD6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms