Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec24aQ3U2P1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec24aQ3U2P1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec24aQ3U2P1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec24aQ3U2P1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 622 ms