Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc174Q3U155 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc174Q3U155 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc174Q3U155 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms