Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd300lgQ1ERP8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd300lgQ1ERP8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300lgQ1ERP8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 482.2 ms