Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sdr16c6Q05A13 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdr16c6Q05A13 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdr16c6Q05A13 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms