Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JupQ02257 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
JupQ02257 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
JupQ02257 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JupQ02257 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JupQ02257 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JupQ02257 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JupQ02257 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JupQ02257 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JupQ02257 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JupQ02257 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
JupQ02257 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JupQ02257 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JupQ02257 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JupQ02257 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JupQ02257 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JupQ02257 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JupQ02257 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JupQ02257 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JupQ02257 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JupQ02257 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JupQ02257 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.32■■□□□ 1
JupQ02257 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JupQ02257 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
JupQ02257 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JupQ02257 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
JupQ02257 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JupQ02257 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JupQ02257 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
JupQ02257 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JupQ02257 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JupQ02257 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JupQ02257 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JupQ02257 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JupQ02257 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
JupQ02257 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JupQ02257 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
JupQ02257 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.28■■□□□ 1
JupQ02257 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JupQ02257 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
JupQ02257 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JupQ02257 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JupQ02257 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JupQ02257 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JupQ02257 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JupQ02257 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
JupQ02257 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JupQ02257 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JupQ02257 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JupQ02257 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JupQ02257 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JupQ02257 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JupQ02257 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JupQ02257 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JupQ02257 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JupQ02257 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JupQ02257 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JupQ02257 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JupQ02257 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JupQ02257 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JupQ02257 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JupQ02257 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
JupQ02257 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JupQ02257 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JupQ02257 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
JupQ02257 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
JupQ02257 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JupQ02257 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JupQ02257 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
JupQ02257 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
JupQ02257 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JupQ02257 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JupQ02257 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JupQ02257 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JupQ02257 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JupQ02257 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JupQ02257 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JupQ02257 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JupQ02257 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JupQ02257 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JupQ02257 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JupQ02257 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JupQ02257 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JupQ02257 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JupQ02257 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JupQ02257 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JupQ02257 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JupQ02257 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JupQ02257 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JupQ02257 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JupQ02257 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
JupQ02257 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
JupQ02257 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JupQ02257 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JupQ02257 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
JupQ02257 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JupQ02257 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JupQ02257 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
JupQ02257 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JupQ02257 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms